Medal of Honor abandona el teatro de la Segunda Guerra Mundial por primera vez en sus 11 años de historia y entra en el escenario moderno del Afganistán devastado por la guerra visto a través de la lente de un pequeño grupo de personajes de ficción. Además, los jugadores conocerán al Operador de Nivel 1, un guerrero de élite e instrumento relativamente desconocido del ejército de EE. UU. que opera bajo la Autoridad del Comando Nacional y asume misiones que nadie más puede realizar.