¡Eres tú contra el malvado Cerebro Madre en la emocionante batalla de Metroid! Estás dentro del planeta fortaleza Zebes. El planeta de los interminables pasadizos secretos donde los Metroid se multiplican. Si se los deja solos, los Metroid son inofensivos. Pero en las manos equivocadas podrían destruir la galaxia. Depende de ti evitar que el Cerebro Madre que controla a Zebes utilice el Metroid con fines malvados. Pero eso no será fácil. Tendrás que usar tu traje espacial para absorber energía valiosa para tu búsqueda y poder usar elementos de poder como Ice Beam, Wave Beam, High Jump Boots y Varia. Si sobrevives, serás tú y tus poderes adquiridos contra el Cerebro Madre.