Si crees que sabías lo que se siente ser el cazarrecompensas detrás de la visera, piénsalo de nuevo. Apunta al mal con el revolucionario mando de Nintendo. Los jugadores controlan a Samus moviéndose con el controlador Nunchuk y apuntando con el puntero, lo que permite un nivel de inmersión como nunca antes habían experimentado. A través de los ojos de Samus, los jugadores experimentan un salto cualitativo en el control en primera persona al empuñar el mando de Wii, el dispositivo definitivo para el género de disparos en primera persona. Samus emplea potenciadores conocidos como Grapple Beam y Morph Ball, así como un montón de nuevas sorpresas, para ayudarla a sobrevivir a las próximas pruebas. Sin embargo, salvar los planetas de la corrupción no es suficiente. Finalmente, los jugadores deben derrotar al enemigo mortal de Samus, Dark Samus.