Mortal Kombat: Deception lleva la serie al siguiente nivel con múltiples muertes por personaje, fondos interactivos y nuevos modos de juego. Por primera vez en la serie Mortal Kombat, puedes jugar un modo Konquest de itinerancia libre, juegos de mesa y un juego de rompecabezas, además del modo de lucha uno a uno mejorado. Mortal Kombat: Deception admite el juego en línea tanto para PS2 como para Xbox Live y presenta partidos y torneos en línea, así como capacidades de juego en línea tanto para el juego de mesa como para los modos de rompecabezas.