En P4AU, los personajes de Persona 4 y Persona 3 una vez más se unen para enfrentarse en P-1 Climax, una serie de batallas que deben ganarse antes de que se acabe el mundo. El elenco original de personajes de Persona 3 y 4 regresa para descubrir el cerebro detrás de todo el torneo, mientras que algunas caras nuevas se unen a la lucha, incluidos Junpei Iori, Yukari Takeba, Rise Kujikawa y más. Pero en su camino se interpone Sho Minazuki, con dos katanas, una gran amenaza para todos los involucrados en el P-1 Climax. Peor aún, hay un doble de Sho que puede manejar una Persona...