Clank tiene una misión. Su mejor amigo, Ratchet, ha sido incriminado por un enemigo despiadado y encarcelado por un crimen que no cometió. No solo eso, sino que la prisión de máxima seguridad de Ratchet está llena de los criminales más peligrosos del universo, la mayoría de los cuales hacen fila para "dar la bienvenida" personalmente a Ratchet a su nueva celda.
Por suerte para Ratchet, tiene a Clank afuera, y por suerte para Clank, es el tipo de pequeño robot inteligente que se muestra tranquilo bajo presión y sabe un par de cosas sobre cómo localizar a un enemigo misterioso. Es por eso que, como el Agente Secreto Clank, está buscando pistas para desentrañar el misterio y asegurar la liberación de Ratchet de la cárcel.
Por suerte para Ratchet, tiene a Clank afuera, y por suerte para Clank, es el tipo de pequeño robot inteligente que se muestra tranquilo bajo presión y sabe un par de cosas sobre cómo localizar a un enemigo misterioso. Es por eso que, como el Agente Secreto Clank, está buscando pistas para desentrañar el misterio y asegurar la liberación de Ratchet de la cárcel.