P4AU では、ペルソナ 4 とペルソナ 3 のキャラクターが再びチームを組んで、世界が終わる前に勝利しなければならない一連の戦いである P-1 クライマックスで対決します。ペルソナ 3 と 4 のキャラクターのオリジナル キャストがトーナメント全体の背後にある黒幕を発見するために戻ってくる一方、伊織 順平、竹葉 ゆかり、久慈川 りせなど、いくつかの新しい顔が戦いに加わります。しかし、彼らの前に立ちはだかるのは、P-1 クライマックスに関わるすべての人にとって大きな脅威である二刀流の皆月翔です。さらに悪いことに、ペルソナを操ることができる翔のそっくりさんもいます...