『ペルソナ 5』は、怪盗団として二重生活を送る、問題を抱えた高校生のグループ（主人公と、ゲームのストーリーで出会う同胞たち）の内外の葛藤を描いたゲームです。
彼らは、授業を受け、放課後にアクティビティをし、アルバイトをするという、東京の高校生としての典型的な日常を過ごしています。しかし、彼らはまた、異世界の力を使って人々の心に侵入するという幻想的な冒険にも乗り出します。彼らの力はペルソナ、つまりユングの「自己」の概念から来ています。
ゲームのヒーローたちは、社会が人々に内面の脆弱性を守るためにマスクの着用を強制していることを認識しており、文字通り彼らの防護マスクを剥ぎ取り、自分の内面と対峙することで、ヒーローたちは内なる力を目覚めさせ、それを使って困っている人々を助けるために努力します。
最終的に、怪盗団は自分たちの認識に合わせて日常世界を変え、現代社会がかぶっている仮面を見破ろうとします。